Як еволюціонуватиме коронавірус?

Зниження рівня нових інфекцій та впровадження вакцин дозволяють деяким говорити про кінець COVID-19. Але ця риторика, на мою думку, є необдуманою та передчасною. За тим, що ми знаємо зараз про SARS-CoV-2, це може не бути питанням місяців до кінця пандемії, а питанням років, якщо не десятиліть. Ми повинні планувати це. Віруси існують, щоб процвітати. Ті, що заражають людей, стикаються з вражливим арсеналом захисних засобів, не лише з нашою природною адаптивною імунітетом, але й з нашими розумно розробленими захисними засобами – вакцинами, ліками та соціальним контролем. Щоб вірус вижив, він повинен бути адаптований до свого вибраного екологічного ніші – у цьому випадку до нас – та бути здатним до подальшої складної адаптації, щоб подолати наші найкращі зусилля щодо запобігання та лікування. Спочатку багато хто припускали, що коронавіруси загалом та SARS-CoV-2 зокрема є більш стабільними та менш схильними до адаптації, ніж інші РНК-віруси, через їх механізми захисту від помилок. Але ми були переконані в неправильності. Минулого літа дослідник з Техасу помітив, що мутований вірус SARS-CoV-2 з заміною в білку шипу перевершив попередні форми, ставши домінуючим штамом. З того часу з’явилося кілька нових варіантів з мутаціями, які можуть зробити вірус більш передавальним, смертоносним та здатним уникнути наших імунних захистів. Ці варіанти, здається, були сформовані наших власних помилках. У Бостоні середнього віку чоловік боровся з інфекцією COVID-19 протягом п’яти місяців, перш ніж померти від хвороби. Він отримував лікування імуносупресивними препаратами, коли захворів, і під час хвороби отримував кілька раундів додаткового лікування, включаючи ремдесивір, неімунну гамма-глобулін та моноклональні антитіла. Під цим імунним тиском з’явилися ключові мутації вірусу. Лікарі та науковці, які бачили їх народження, назвали це “прискореною вірусною еволюцією”. Інші віруси, такі як грип, також показали себе здатними до швидкої еволюції, коли стикалися з нашими найкращими захистами. Насправді, на основі того, що ми бачили з SARS-CoV-2 та його здатності до варіацій, я б сказав, що цей вірус набагато більше схожий на грип, ніж на будь-який інший вірус, відомий до цього часу. Це означає, що еволюційний шлях грипу може містити важливі вказівки про дорогу, яку пройде COVID-19. Грип, як ми знаємо, приходить і проходить в сезонних хвилях в Північній і Південній півкулях. В тропіках він відбувається протягом всього року з невеликими піками. Ця модель наслідує те, що ми знаємо про коронавіруси, які спричиняють застуду, які, відколи їх відкриття в 1960-х роках, повертаються щорічно, щоб заражувати нас. Для грипу антигенний дрейф – накопичення невеликих генетичних змін в вірусі – був основним поясненням для повторюваних сезонних епідемій. Домінуючі штами грипу еволюціонують з року в рік, а імунітет, який ми розвиваємо від попереднього штаму, має тільки приглушений ефект на новий штам. Ми дізналися нещодавно, що імунітет до грипу також зникає, часто зникненням протягом року, що також робить нас вразливими до повторного зараження. Ми колись вважали, що коронавіруси, що спричиняють застуду, є стійкими – тобто без антигенного дрейфу – але повертаються щорічно через зникнення імунного захисту. Але протягом минулого року наше розуміння коронавірусів покращилося, і ми тепер знаємо, що принаймні один з коронавірусів, який спричиняє застуду, позначений як 229Е, проходить антигенний дрейф, подібний до грипу. SARS-CoV-2, подібний до 229Е, вже показав, що він може дрейфувати. Але, подібно до грипу, він також показав себе здатним до значних та раптових змін. Одним зі способів, які можуть призводити до таких серйозних змін, є переміщення вірусу на нову популяцію, наприклад від тварин до людей або навпаки. Коли вірус робить цей стрибок, виникають великі речі – і часто погані речі. Як SARS-CoV-2, так і грип мають великі популяції тварин. Коронавіруси заражали кожний вид хребетних, від китів та кажанів до саламандерів та змій. Грип є подібним. Це означає, що вони обидва можуть еволюціонувати, щоб стати набагато більш шкідливими для нашої популяції. Попередні два вибухи коронавірусу почалися, коли коронавіруси перескочили з тварин на людей, від циветок в 2003 році з SARS та від верблюдів з MERS в 2012 році. Ймовірно, пандемія грипу 1918 року почалася з переходу від тварин теж. Якщо ми матимемо щастя, SARS-CoV-2 еволюціонує, як грип, щоб стати менш летальним. Після зараження орієнтовно 500 мільйонів людей по всьому світу та вбивства щонайменше 50 мільйонів, вірус грипу 1918 року відступив. Але надія на те, що цей коронавірус зменшиться з часом, не гар