Міста мають свої власні унікальні мікробні відбитки

У 2015 році генетик Кріс Мейсон розпочав збір зразків мікробів з метою вивчення їх співіснування з людьми в системах громадського транспорту Нью-Йорка. Після того, як його дослідження показало наявність багато невідомих видів у місті, його контактували інші дослідники. Тепер Мейсон та десятки співавторів опублікували дослідження метро, автобусів, підвісних поїздів та трамваїв у 60 містах по всьому світу. Вони ідентифікували тисячі нових вірусів і бактерій та виявили, що кожне місто має унікальний мікробіологічний “відбиток”. Дослідження визнано фантастичним, а його дані будуть аналізувати ще десятиліттями. Зразки були зібрані шляхом забору ДНК з поверхонь, що є загальними для транзитних систем скрізь: лавки, турнікети та квиткові кіоски. Дослідники знайшли, що більше 45% не відповідає жодному відомому виду: майже 11 000 вірусів та 1302 бактерії були новими для науки. Вони також знайшли набір з 31 виду, присутніх у 97% зразків, які сформували так звану “ядро” міського мікробіому. Інші види, які були менш поширеними, дали кожному місту унікальний мікробіом. Дослідження може бути корисним для судової медицини, а нові види мають потенціал для досліджень ліків. Головне значення дослідження полягає в його відкритих даних, доступних на metagraph.ethz.ch, що дасть іншим дослідникам можливість досліджувати нові питання. Дослідження також показало, що метро є безпечним місцем, а гени антибіотиків були присутні на набагато нижчому рівні, ніж у зразках з кишківника або лікарень.