Вірус чи бактерія? Швидкий тест визначає причину зараження

Кашель, насморк, підвищена температура: щодня пацієнти з цими симптомами звертаються до клінік. Але чи є винуватець бактерія, яку можна атакувати антибіотиками, чи вірус, який важче лікувати? Часто лікарі не можуть бути впевнені. Але дослідники кажуть, що вони наближаються до точного тесту, який може швидко зробити відповідь прямо в кабінеті лікаря. У разі невідомої інфекції лікарі іноді замовляють лабораторні тести на загально поширені бактерії, такі як стрептококи. Або вони можуть відразу спробувати антибіотики, базуючись на сили симптомів, але зловживання антибіотиками може призвести до небезпечності резистентних бактерійних штамів. “Коли розрізнення може бути зроблене швидко, ми можемо забезпечити те, щоб антибіотики не призначалися неправильно”, – каже спеціаліст з інфекційних хвороб університету Дюка Ефрем Цалік. У 2016 році він і його колеги розробили лабораторний тест, який пов’язує загальні респіраторні симптоми з вірусними, бактеріальними або неінфекційними походженнями. Він працює тому, що кожен патоген активує різний набір генів, змінюючи їхню РНК або виробництво білків, і тест може виявляти ці характерні “експресії генів” в невеликому зразку крові. Команда нещодавно співпрацювала з компанією BioFire, щоб прискорити цей тест із результатами за годину. Новий процес, протестований на понад 600 пацієнтах в екстреної допомоги для дослідження в Лікувальній Медицині, визначив бактеріальні інфекції з точністю 80% і вірусні інфекції майже на 87%. Загальний лабораторний тест, який перевірив Цалік, мав приблизно 69% точності. Інші потребують часомірного культивування або можуть підтвердити лише конкретні патогени, які лікар вирішує протестувати. Технологія для вивчення реакції генів на патогени у швидкий та інтегрований спосіб була розроблена зовсім недавно, каже комп’ютерний імунолог університету Стенфорда Пурвеш Хатрі, який не брав участь у дослідженні. Посилення РНК через методи на основі ПЛР, ключовий аналітичний крок, тепер може бути зроблено за 15-20 хвилин. Хатрі співзасновник Inflammatix, компанії, яка незабаром випустить свій власний швидкий тест “щоб сказати, чи є інфекція і який [патоген] ймовірно її спричинив і також дати інформацію про тяжкість”. Інструменти для допомоги у обмеженні зловживання антибіотиками для респіраторних інфекцій “можуть мати значний вплив на зменшення росту резистентності до антибіотиків”, – каже спеціаліст з інфекційних хвороб університету Вашингтона в Сент-Луїсі Грегорі Сторч, який не брав участь у дослідженні. І якщо люди з різних народів та з певними попередніми умовами можуть показувати різні моделі експресії генів, Сторч сподівається, що майбутня робота врахує такі відмінності, щоб забезпечити надійні результати для всіх.